Με καταγωγή από τη Χίο, γεννήθηκε στο Πλωμάρι ήταν ένα από τα τρία παιδιά της οικογένειας του Φιλλίπου Κλειδαρά και της Ασπασίας Μαμάκου. Από ηλικία 12 ετών είχε αφοσιωθεί στην χριστιανική θρησκεία .
Το 1964 με απόφασή του ο Μητροπολίτης Μυτιλήνης Ιάκωβος καθιστά Ηγουμένη της Ιεράς Μονής του Αγίου Ραφαήλ τη Μοναχή Ευγενία Κλειδαρά. Η Ηγουμένη από τότε αφιέρωσε τη ζωή της στο ρόλο αυτό και με το συγγραφικό της έργο συνέβαλλε καθοριστικά στην προβολή του Μοναστηριού.
Το μοναστήρι του Αγίου Ραφαήλ και η επιβλητική εκκλησία του αποτελούν πια πόλο έλξης για χιλιάδες πιστούς απ' όλον τον κόσμο.
Τα τελευταία χρόνια λόγω ασθένειας είχε περιορίσει τις δημόσιες εμφανίσεις της. Η ίδια αγαπήθηκε, από πιστούς αλλά και επικρίθηκε έντονα κατά καιρούς για θέματα που αφορούν τη διαχείριση της περιουσίας της Μονής.